Bij applicatievirtualisatie worden de applicaties losgekoppeld van het besturingssysteem. Er zijn verschillende redenen om hiervoor te kiezen. Ten eerste zorgt applicatievirtualisatie voor een veel dynamischer werkplek voor gebruikers. Een tweede mogelijke reden is dat uitgefaseerde applicaties met een vingerknip weer terug zijn te halen. Daarnaast wordt het updaten makkelijker. Vooral de mogelijkheid onafhankelijk van het uitvoeringsplatform te kunnen werken zal veel IT-afdelingen en ondernemingen aanspreken, zo zegt Ruben Spruijt, Solution Architect bij PQR.
Bij applicatevirtualisatie geldt ook een aantal kanttekeningen. Ten eerste is applicatievirtualisatie alleen geschikt voor organisaties met Windows-applicaties. Ten tweede kan zo`n 5% van de applicaties niet gevirtualiseerd worden. Verder kan de ene leverancier meer virtualiseren dan de andere.