In de nieuwe methode is naar een breder geheel gekeken bij de lijn. Daardoor konden aanpassingen in de infrastructuur beperkt blijven. De nieuwe ontwerpmethodiek werd gekozen in het kader van een afstudeeronderzoek aan de Universiteit van Amsterdam. De methodiek vergemakkelijkt de zoektocht naar railprojecten met een positieve maatschappelijke kosten-baten-analyse (MKBA). De methode werd ook losgelaten op andere trajecten, Randstad-Twente, Arnhem-Twente en Randstad-Ede-Arnhem-Nijmegen.
Met de nieuwe methodiek werd aangetoond dat er een versnelling mogelijk was op de baanvakken Amsterdam-Utrecht en Utrecht-Arnhem. Door infrastructurele aanpassingen kan sneller gereden worden en zijn meer rechtstreekse verbindingen mogelijk. Daardoor valt de MKBA voor HSL-Oost positief uit op 1,5.
