De verwachting is dat door het ontbreken van aandacht in Den Haag het programma een fiasco zal worden. Een expertgroep onder leiding van Arthur Docters van Leeuwen, oud-voorzitter van de Autoriteit Financiële Markten, vindt het NUP onder meer te groot, te complex, te ICT-gericht en onsamenhangend en met gebrekkige regie kampend. Door de grote afstand tot de werkvloer binnen NUP is geen goede invoering mogelijk.
Volgens Eddy Oosthoek, ambtelijk secretaris van GV PinkRoccade Local Government, is er te weinig aandacht voor samenhang, planning en afstemming binnen NUP. Dit zorgt voor verwarring bij gemeenten die gebruik moeten maken van de e-overheid. Er is bijvoorbeeld nooit een volledige businesscase voor het NUP opgesteld met alle kosten en opbrengsten in beeld. Ook is nooit inzicht gegeven in welke bedragen voor wiens rekening komen. Dit kan er toe leiden dat gemeenten straks ergens in moeten investeren zonder dat zij dit terug kunnen verdienen.
